Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Pbrm1Q8BSQ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbrm1Q8BSQ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pbrm1Q8BSQ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms