Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zcchc4Q8BKW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zcchc4Q8BKW4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms