Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms