Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdca8Q8BHX3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdca8Q8BHX3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms