Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg4dQ8BGV9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg4dQ8BGV9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms