Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htatsf1Q8BGC0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htatsf1Q8BGC0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms