Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc50Q810U5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc50Q810U5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms