Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChfrQ810L3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChfrQ810L3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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