Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms