Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc28Q80XJ3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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