Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc12Q80WJ6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc12Q80WJ6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms