Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Npm2Q80W85 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Npm2Q80W85 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npm2Q80W85 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms