Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ell3Q80VR2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ell3Q80VR2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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