Protein–RNA interactions for Protein: Q80V91

Dtx3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3Q80V91 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Dtx3Q80V91 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx3Q80V91 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms