Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actr5Q80US4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Actr5Q80US4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms