Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep170bQ80U49 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep170bQ80U49 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms