Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
NischQ80TM9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NischQ80TM9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
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