Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rpap1Q80TE0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rpap1Q80TE0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpap1Q80TE0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms