Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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