Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim17Q7TPM3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim17Q7TPM3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms