Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prrc2bQ7TPM1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms