Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smap2Q7TN29 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms