Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uhrf2Q7TMI3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf2Q7TMI3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms