Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nup188Q6ZQH8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup188Q6ZQH8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms