Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Topbp1Q6ZQF0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Topbp1Q6ZQF0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms