Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nemp1Q6ZQE4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nemp1Q6ZQE4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms