Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy1Q6ZQ11 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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