Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HjurpQ6PG16 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HjurpQ6PG16 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms