Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc85bQ6PDY0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc85bQ6PDY0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms