Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2lQ6PDS0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.1 ms