Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dtx4Q6PDK8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dtx4Q6PDK8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms