Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trak1Q6PD31 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms