Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp49Q6P9L4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp49Q6P9L4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp49Q6P9L4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp49Q6P9L4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp49Q6P9L4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp49Q6P9L4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp49Q6P9L4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp49Q6P9L4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp49Q6P9L4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp49Q6P9L4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp49Q6P9L4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp49Q6P9L4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp49Q6P9L4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp49Q6P9L4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms