Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BC061212Q6P8K3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms