Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2aQ6P4T0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2aQ6P4T0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms