Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frg2f1Q6P3A2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frg2f1Q6P3A2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms