Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrimpolQ6P1E7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms