Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slx4Q6P1D7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slx4Q6P1D7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms