Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pprc1Q6NZN1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pprc1Q6NZN1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pprc1Q6NZN1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms