Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gpbp1Q6NXH3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gpbp1Q6NXH3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms