Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SphkapQ6NSW3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SphkapQ6NSW3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SphkapQ6NSW3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms