Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cep78Q6IRU7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms