Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CltbQ6IRU5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms