Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ParpbpQ6IRT3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms