Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Krt40Q6IFX3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt40Q6IFX3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Krt40Q6IFX3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Krt40Q6IFX3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Krt40Q6IFX3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Krt40Q6IFX3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Krt40Q6IFX3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt40Q6IFX3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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