Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rftn1Q6A0D4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms