Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc5lQ6A068 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc5lQ6A068 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms