Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
N4bp1Q6A037 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
N4bp1Q6A037 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms