Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk13Q69ZA1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk13Q69ZA1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk13Q69ZA1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms