Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kiaa1549Q68FD9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms